En 1994 llega a las tiendas la tan esperada continuación de la saga, Sonic The Hedgehog 3, para Mega Drive, la consola líder de SEGA.
En este juego, por defecto, los dos personajes, Sonic y Tails, aparecen a la vez en pantalla permitiendo así el modo multijugador. Aunque si no hay jugador 2 la CPU toma el control de Tails. También es posible el modo «clásico» 1 Player Solo Sonic o 1 player Solo Tails
Una curiosidad sobre esta entrega es la leyenda de que el mismísimo Michael Jackson hizo parte de la música.
Esto se confirmó años después de la muerte del cantante, con declaraciones del resto del equipo de producción a The Huffington Post que revelaban que sus composiciones aún se pueden escuchar en el juego pero que él eligió desvincularse y no asociar su nombre al quedar insatisfecho cuando escuchó la calidad de su música en la consola de 16 bits.